Program P2MPD secara umum bertujuan untuk:

·             Mengembangkan dan memperkokoh proses pelaksanaan desentralisasi melalui pentahapan yang digunakan di gunakan di dalam perencanaan, pelaksanaan, pemantauan, dan evaluasi, serta operasi dan pemeliharaan proyek.

·           Membantu mempercepat pemulihan dampak krisis melalui penyediaan hibah langsung ke desa-desa untuk membiayai pembangunan prasarana.

Keduanya dilakukan melalui pendekatan pelaksanaan pembangunan daerah dengan meningkatkan transparansi, akuntabilitas, dan peranserta masyarakat pada semua tahap pembangunan (pemilihan, perumusan, dalam pelaksanaan pembangunan).

Tujuan Khusus P2MPD adalah:

·           Menurunkan tingkat kemiskinan melalui peningkatan akses masyarakat miskin terhadap layanan umum dasar dan memulihkan kegiatan ekonomi.

·                Mendukung usaha-usaha desentralisasi pemerintah melalui peningkatan prosedur-prosedur transparansi, ketatanegaraan, pengawasan, akuntansi, dan pelaporan pada tingkat Kabupaten.

·            Memberdayakan masyarakat desa/kelurahan dan kabupaten/kota untuk berperan aktif dalam pembangunan daerah.

Sasaran utama program P2MPD ini adalah masyarakat miskin yaitu yang paling menderita karena dampak krisis ekonomi, merekalah yang harus mendapat prioritas utama dan diberdayakan dalam pelaksanaan program P2MPD.  Selain pemberdayaan terhadap masyarakat tersebut, pemberdayaan terhadap Pemerintah Daerah juga harus dilaksanakan sehingga mampu  dalam pelaksanaan konsep otonomi daerah, menyusun dan melaksanakan program-program pembangunan daerah secara transparan, accountable, mandiri, independen, dan tepat guna.